绿柱石要定期净化，因为绿柱石的物理性质决定不能随便使用酸性、或者碱性的清洗剂，因此在科学上用御守盐这样中性的清洗剂是正确的和安全的。是天然的晶石、玉石都有裂纹，但是人工处理填充物因为和御守盐可以产生反应，所以在商业上被摒弃，加上因为出产在日本所以很多盲目排外的人就憎恶。绿柱石需要1到3各月净化一次。即便是开光的也需要定时净化这是有原因。净化这个词在拉丁语和消磁近似，所以也叫做消磁。很多人常有疑惑为什么要净化为什么要消磁，这是有科学依据和神学基础的。净化是从改革开放后外国传入中国的。因为道教、佛教在中国文化中影响很大，所以粪便、血液被认为是很神圣的。
